当初の甲州街道は、青柳（国立市）付近から多摩川を「万願寺渡船場」に渡り、この一里塚を経て日野宿に至るものであった。その後、貞享元年（1684）に再度整備され、上流の「日野渡船場」を渡る道筋に改められた。しかし、万願寺渡船場と道は、その後も利用され続けた。
万願寺一里塚は江戸日本橋から9里目、10里目の日野台を通り、八王子で11里目に至る。なお、塚を越えると日野宿であることから、この周辺は「塚越」と呼ばれていた。

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